基礎醫學院主要承擔醫學類本科、研究生各專業及留學生的前期醫學基礎課程教學;目前設有18個教學、科研和管理機構;有專兼職教職工87人,其中正高級專業技術人員21人;設備總值達1400余萬元。學院綜合實力較強,擁有2個省級重點學科、1個省級重點專業、1個省級特色專業、1個省級新增博士學位建設項目建設點、1個省高校重點實驗室、1個省高校示范實驗室、2門省級精品課程、1個省高校優秀教學團隊。學院的專業技術人員先后主持承擔了包括國家自然科學基金、云南省自然科學基金和云南省科技創新強省重點項目在內的70余項科研項目,在國內外學術刊物發表各種學術研究論文1000余篇,出版教材和教學參考書30余部。
醫學檢驗專業(本科五年):培養從事醫學檢驗工作,掌握醫學基本理論與實驗操作技能,具有較強科學思維和分析解決問題能力的高級人才。主要課程:分析化學、儀器分析、醫學寄生蟲學與檢驗、臨床生化檢驗、臨床免疫、微生物及檢驗、臨床檢驗學等。學位授予:醫學學士。就業方向:各級各類醫療衛生機構。