食品科學與工程專業是在原生物工程的發酵食品工程方向發展起來的工學類本科專業，2009年單獨設置專業，2010年正式面向全國招生，現有在校全日制本科學生130名。食品科學與工程專業培養德、智、體、美全面發展，具有較高的思想道德素質、人文素質、業務素質和身心素質；具有較強的創新精神和較高的專業綜合能力、拓展能力，以及一定的科研和解決實際問題等專業發展能力；愿意為區域社會經濟發展服務的高級應用型專門人才。
該專業現有專業教師14人，其中教授5人、副教授4人；博士6人、碩士4人；該專業有較好的辦學條件，擁有食品科學與工程中央與地方共建特色優勢學科實驗室，和發酵食品生產、果汁生產、面點生產等生產線和學生實訓中心；擁有懷化市農產品生產與加工重點實驗室，以及特色農產品加工創新性實驗點，教學、科研實驗用房面積近3000平方米，儀器設備總價值200余萬元。
該專業以培養食品行業應用型人才為宗旨，畢業要求具備獨立進行傳統食品加工工藝設計、現代食品加工工藝設計、加工設備選用、工廠設計、食品生產管理與質量監控、技術經濟分析和產品營銷等專業發展能力，獲得勞動與社會保障部頒發的三級以上公共營養師或食品檢驗員專業技術證書。
該專業主要課程有食品化學與分析、食品微生物學、食品營養學、食品加工技術原理、食品機械與設備、化工儀表及自動化、食品添加劑、食品貯運學、食品衛生與毒理學、現代食品檢驗技術、乳與乳制品工藝學、肉灌制品工藝學、蛋制品工藝學、軟飲料工藝學、果蔬加工工藝學、發酵制品工藝學、糧油加工工藝學、焙烤制品工藝學、大豆制品工藝學等；實踐環節包括課程實驗實訓、課程見習、生產實習、科技活動、課程設計、專業實習、畢業論文（設計）等。
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