玉溪農業職業技術學院的前身是國家級重點中專玉溪農業學校,學校成立于1956年,1991年經省教委評估認定為“合格中專學校”;1993年被省政府認定為“省部級重點中專學校”,同年省政府批準建立“云南省玉溪煙草栽培學?!?1996年被省科委、團省委定為“云南省青年星火技術培訓示范基地”,并獲云南省農業中專教學規范化管理一等獎;1997年省教委命名為“省級文明學?!?1998年被省委、省政府命名為“省級文明單位”;1999年被省委、省政府命名為“文明單位工作先進單位”;2000年首批步入國家級重點中專行列。于2002年3月22日經省政府批準,國家教育部備案,成立以舉辦高等職業技術教育為主、面向全國招生的普通全日制公辦高等職業學校(即玉溪農業職業技術學院)。
學院已基本形成了以專科為主體、中專、本科多層次學歷教育和各類短期培訓并存的辦學格局,現有全日制在校生3000多人。學院設有煙草栽培技術、現代農業技術、生物資源開發與利用、觀賞園藝、園林設計、計算機應用技術、計算機網絡技術、廣告藝術設計、計算機多媒體技術、室內設計、財會會計、金融保險、社區管理與服務、農業經濟管理、市場營銷、電子商務、畜牧獸醫、動物醫學等18個專業。學院是第110個國家職業技能鑒定所,面向學生和社會開展農林牧、園藝、會計、計算機等行業的相關等級培訓和鑒定,頒發全國統一的職業資格證書。